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Fasta整形

cat data | sed -e '/^>/ s/$/</` | tr -d '\n' | sed -e s/>/\n/gp' | sed -e 's/>/\n/gp' > reference

cat data | sedにデータを渡す

sed -e '/^>/ s/$/</` | /^>/ 行頭に>のある行を選ぶ s/$/</ 行末に<を加える

tr -d '\n' "\n"を削除

sed -e 's/>/\n>/gp' ">"を"\n>"に置換

sed -d 's/</\n/gp' "<"を"\n"に置換

reference

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